目的：为不同类型中药小分子体外筛选及设计合成改造提供参考。方法：以“圆二色光谱”“中药小分子与DNA”“中药小分子与蛋白质”“Circular dichroism”“Interaction of traditional Chinese medicine and DNA”“Interaction of traditional Chinese medicine and protein”等为关键词，组合查询2005年1月－2016年4月在PubMed、Web of Science、Wiley Online Library、SpringerLink、中国知网、万方、维普等数据库中的相关文献，对圆二色光谱（CD）在中药小分子与DNA、中药小分子与蛋白质相互作用中的应用进行综述。结果与结论：共检索到相关文献349篇，其中有效文献54篇。生物碱、黄酮类、醌类、苯丙素类、植物色素等类型的中药小分子，与 DNA 相互作用以沟槽结合和嵌插结合2种模式为主；苯丙素类、黄酮类、萜类、生物碱、醌类等类型的中药小分子，与蛋白质结合后，通常使其α-螺旋、β-转角和无规则卷曲等二级结构发生改变。后续进行诱导圆二色谱的探索性研究，可得到更多两者相互作用的结合信息，如中药小分子与DNA的结合序列及与蛋白质的结合位点；还可将CD与紫外-可见吸收光谱法、荧光光谱、分子模拟等技术联用，以实现多种技术互为验证、互为补充。